001云霄飞车杀人事件（
琴酒、伏特加出场，
工藤新一被灌下药变小）002董事长千金诱拐事件（阿笠博士知道他的身份，工藤新一化名为
江户川柯南）004大都会
暗号地图藏宝事件（少年侦探团成立）005新干线大爆破事件（知道黑衣人代号）【动画、漫画剧情不同】013奇怪的寻人事件（宫野明美第一次出场）【动画漫画剧情不同】043江户川柯南诱拐事件（工藤夫妇知道新一变小）049外交官杀人事件（后篇）（服部平次登场，工藤新一第一次恢复）054电玩公司杀人事件（龙舌兰出现，被炸死）058福尔摩斯迷杀人事件（后篇）（平次知道柯南的身份，二人成挚友）118浪花连续杀人事件（沼渊己一郎第一次出场，被警方逮捕）128黑暗组织10亿抢劫事件（宫野明美死亡，黑衣组织浮出水面）129来自黑暗组织的女子大学教授杀人事件（
灰原哀出场，组织代号“
雪莉”，说出药名是）130竞技场无差别恐吓事件（前篇）（灰原说：“工藤，我想你从来没想过吧，半世纪前你已经在我们组织进行的秘密计划中，已经有很大关联了。”）162飞天密室工藤新一最初的事件（小兰回忆工藤新一最初的事件）170黑暗之中的死角（前篇）（重要人物新出智明医生登场）176与黑暗组织的再会（灰原篇）（匹斯可出场，任务为暗杀吞口重彦。
贝尔摩德出场）177与黑暗组织的再会（柯南篇）（宫野志保第一次恢复，匹斯可知其身份）178与黑暗组织的再会（解决篇）（匹斯可被琴酒灭口，灰原哀逃脱。揭示贝尔摩德组织成员身份）188危命的复活洞窟内的侦探团189危命的复活负伤的名侦探190危命的复活第三种选择（工藤新一第二次恢复）191危命的复活黑衣骑士192危命的复活新一回来了193危命的复活约定的场所222人鱼失踪记（事件篇）（提到了宫野志保，暗示灰原的研究与长生不老有关）226格斗游戏的陷阱（前篇）（茱蒂出场）227格斗游戏的陷阱（后篇）（茱蒂称呼柯南为Coolguy【小酷男】）230谜一样的乘客（前篇）（
赤井秀一出场。灰原感觉到汽车上有强烈的组织成员气息）242元太的灾难（提到琴酒是左撇子）254本厅刑事爱情物语4（后篇）（新出医生能够发现了柯南分析案情并利用变声器）258来自芝加哥的男子（前篇）（詹姆斯·布莱克出场）259来自芝加哥的男子（后篇）（詹姆斯称呼柯南为福尔摩斯、Coolguy）269犯罪的遗物（前篇）（毛利小五郎的卷宗被盗，目标直指柯南）270犯罪的遗物（后篇）272急忙掩饰的忽略（后篇）（柯南被怀疑，形势危急）274幽灵屋的真相（前篇）（新出医生住所，柯南也认为新出听到了柯南分析案情）277英语教师VS西部名侦探（前篇）（柯南让博士调查克丽斯·温亚德）284中华街雨中的似曾相识（前篇）（小兰回忆起包含克丽斯和秀一的纽约的事情）285中华街雨中的似曾相识（后篇）286工藤新一纽约事件（事件篇）（知道克丽斯是美国已故大明星
莎朗·温亚德的女儿）287工藤新一纽约事件（推理篇）288工藤新一纽约事件（解决篇）（贝尔摩德杀死真正杀人魔后假扮成杀人魔登场，赤井秀一对其进行追踪。兰知道秀一是FBI。贝尔摩德打算杀死秀一，却被打伤。兰和新一救下受伤的杀人魔。结尾处，莎朗对有希子说：“我也有我的了。”为后续剧情作铺垫）290迷途森林中的光彦（后篇）（提到沼渊己一郎是组打算培养的杀手，却被其逃脱。最后沼渊再次被警方逮捕）307无声的证据（前篇）（得知龙舌兰生前信息，再次抓住黑暗组织的尾巴）308无声的证据（后篇）（下一集的引子）309与黑暗组织的接触（交涉篇）（柯南、小兰路上偶遇赤井秀一。小兰告诉柯南秀一是FBI。柯南得知组织在雇佣电脑工程师编写一个神秘的系统软件）310与黑暗组织的接触（追踪篇）（对板仓卓的日记进行详细研究，获得情报）311与黑暗组织的接触（殊死篇）（追踪组织，险些被琴酒发现。灰原哀对赤井秀一有感觉）335东京现影所的秘密（前篇）（柯南、灰原被跟踪，山雨欲来）336东京现影所的秘密（后篇）（追踪者为秀一手下，跟踪失败。秀一对着灰原的照片说：“真是像啊。”）339四辆
保时捷658巧克力的炙热陷阱◆
659与初恋的共同搜查（前篇）
660与初恋的共同搜查（后篇）
661小五郎是好人（前篇）
662小五郎是好人（后篇）
663追逐深山锹形虫◆
664名犬Cool的功劳Ⅱ◆
665疑惑的姓名首字母K◆
666雨夜的恐吓犯◆
667婚礼前夕（前篇）
668婚礼前夕（后篇）
669黑暗塔的秘宝（前篇）◆
670黑暗塔的秘宝（后篇）◆
671侦探们的夜想曲（事件）
672侦探们的夜想曲（诱拐）
699【690】工藤优作未解决的事件（前篇【2013年3月9日播出】
700【691】工藤优作未解决的事件（后篇【2013年3月16日播出】
701【692】隅田川的夜樱风景线（上集）【2013年3月23日692动画原创】
702【693】隅田川的夜樱风景线（下集）【2013年3月30日693动画原创】
703【694】消失老店的日式点心【2013年4月20日694剧场版连动】
704【695】葡萄园里的玫瑰花【2013年4月27日695动画原创】
705【696】花坛破坏者的阴谋【2013年5月4日696动画原创】
706【697】女子学园的窗口【2013年5月11日697动画原创】
707【698】相信吗！UFO堕落事件【2013年5月18日698动画原创】
***【340】隐藏在厕所中的秘密（前篇）【2013年5月25日340重播】
***【341】隐藏在厕所中的秘密（后篇）【2013年6月1日341重播】
708【699】逼近灰原秘密的黑影（上集）【2013年6月8日Vol.77】
709【700】逼近灰原秘密的黑影（下集)【2013年6月15日Vol.77】
【重播307】没有留下声音的证据（上集)【2013年6月22日307重播】
【重播308】没有留下声音的证据（下集）【2013年6月29日308重播】
伪712【701】漆黑的特快列车（发车）◆◆【2013年7月13日Vol.78】
伪713【702】漆黑的特快列车（隧道）◆◆【2013年7月20日Vol.78】
伪714【703】漆黑的特快列车（交叉）◆◆【2013年7月27日Vol.78】
伪715【704】漆黑的特快列车（终点）◆◆【2013年8月3日Vol.78】
伪716【705】密室中的柯南（上集)◆◆【2013年8月10日Vol.78】
伪717【706】在波本面前解谜◆◆【2013年8月17日Vol.78】
【重播某一集】【2013年8月24日重播】
【707】被陷害的名侦探◆◆【2013年8月31日动画原创】
【708】缓慢坠落的男子◆◆【2013年9月7日动画原创】
【709】未确认冲击事件◆◆【2013年9月14日动画原创】
【710】每个人都看见了（前篇）
【711】每个人都看见了（后篇）
【712】服部平次与吸血鬼公馆（一）
【713】服部平次与吸血鬼公馆（二）
【714】服部平次与吸血鬼公馆（三）
【715】服部平次与吸血鬼公馆（四）
【716】能面宅邸的鬼在跳舞（前篇）
【717】能面宅邸的鬼在跳舞（后篇）
注意：以下黄字部分并非全为主线，只是最近更新的，想看的同学直接按照目录在网上搜索即可
【718】恶魔的循环◆◆
【719】白金门票骚动记
【720】2013年柯南旅游篇：火与水的神秘之旅（阿苏篇）
【721】2013年柯南旅游篇：火与水的神秘之旅（熊本篇）
【722】又甜又冷的宅急便（前篇）
【723】又甜又冷的宅急便（后篇）
【重播46】雪山山庄杀人事件【2013年12月28日】
【724】怪盗基德与赤面人鱼（前篇）【2014年1月4日Vol.78-79】
【725】怪盗基德与赤面人鱼（后篇）【2014年1月11日Vol.78-79】
【726】招来不幸的幸运邮件【2014年1月18日动画原创】
【727】堆满水果的宝箱（前篇）【2014年1月25日Vol.80】
【728】堆满水果的宝箱（后篇）【2014年2月1日Vol.80】
【729】钻石与绘画与大女演员【2014年2月8日动画原创】
【730】太过完美的图形【2014年2月22日动画原创】
【731】现场的邻居是前男友（前篇）【2014年3月1日Vol.80】
【732】现场的邻居是前男友（后篇）【2014年3月8日Vol.80】
【733】宴会与两声枪响【2014年3月22日动画原创】
【734】茱蒂的追忆与赏花的陷阱◆◆【2014年3月29日Vol.80~81】
（1小时特别版）
【735】附带暗号的邀请函【2014年4月19日动画原创】
【剧场版】异次元的狙击手【2014年4月19日】
【736】毛利小五郎的秘密【2014年4月26日动画原创】
【737】疑惑的散步道【2014年5月3日动画原创】
【738】小五郎在酒吧里（前篇）◆◆【2014年5月10日Vol.81】
【739】小五郎在酒吧里（后篇）◆◆【2014年5月17日Vol.81】
【740】倒在浴室里的小兰（前篇）◆◆【2014年5月31日Vol.81】
【741】倒在浴室里的小兰（后篇）【2014年6月7日Vol.81】
【742】与J联盟的约定【2014年6月14日动画原创】
【743】偶然地两次重叠【2014年6月21日动画原创】
【744】嫌疑犯是京极真（前篇）【2014年6月28日Vol.81】
【745】嫌疑犯是京极真（后篇）◆◆【2014年7月5日Vol.81】
【746】怪盗基德vs京极真（前篇）【2014年7月19日Vol.82】
【747】怪盗基德vs京极真（后篇）【2014年7月26日Vol.82】
【748】警视厅爱情物语（告白）【2014年8月2日Vol.82】
【749】总局刑警爱情物语（真相）【2014年8月9日Vol.82】
【750】被海背叛的男子【2014年9月6日动画原创】
【751】招财三毛猫事件（前篇）【2014年9月20日Vol.82】
【752】招财三毛猫事件（后篇）【2014年9月27日Vol.82】
【753】合租公寓的死角【2014年10月4日动画原创】
【754】赤女的惨剧（雾气）【2014年10月11日Vol.82~83】
【755】赤女的惨剧（恶灵）【2014年10月18日Vol.82~83】
【756】赤女的惨剧（复仇）【2014年10月25日Vol.82~83】
【757】动画原创自首的搞笑艺人（前篇）【2014年11月1日动画原创】
【758】动画原创自首的搞笑艺人（后篇）【2014年11月8日动画原创】
【759】爱情小说的意外成果（前篇）【2014年11月22日Vol.83】
【760】爱情小说的意外成果（后篇）【2014年11月29日Vol.83】
【761】加贺百万石神秘之旅（金泽篇）【2014年12月6日动画原创】
【762】加贺百万石神秘之旅（加贺温泉篇）【2014年12月13日】
【重播45】敷面膜杀人事件【2014年12月20日】
【特别篇】江户川柯南失踪事件-史上最惨的两天-【2014年12月26日《盗钥匙的方法》的剧情延续（2小时特别版）】
2015年（763－）
【特别篇】新年欢愉毛利小五郎[15]【2015年1月3日Vol.57】
【763】柯南与平次爱情的暗号（前篇）【2015年1月10日Vol.83】
【764】柯南与平次爱情的暗号（后篇）【2015年1月17日Vol.83】
【765】堤无津川风筝事件（前篇）【2015年1月24日Vol.84】
【766】堤无津川风筝事件（后篇）【2015年1月31日Vol.84】
【767】消失在风雪中的情人【2015年2月7日动画原创】
【768】灰原哀监禁事件【2015年2月21日动画原创】
【769】麻烦的急救患者【2015年2月28日动画原创】
【770】气氛僵硬的茶会（前篇）2015年3月7日Vol.84】◆
【772】工藤新一水族馆事件（前篇）
【773】工藤新一水族馆事件（后篇）
【774】消失的蒙克呐喊
【775】被操纵的名侦探（前篇）
【776】被操纵的名侦探（后篇）
【777】少年侦探团VS老年侦探团
【778】消失在海市蜃楼的天使
【779】绯色的序章
【780】绯色的追寻
【781】绯色的交叉
【782】绯色的回归
【783】绯色的真相
【784】欢迎来到织女俱乐部
【785】太阁爱情名人战（前篇）
【786】太阁爱情名人战（后篇）
【787】沉入盛夏游泳池的谜团（前篇）
【788】沉入盛夏游泳池的谜团（后篇）
【789】女王陛下的气象预报
【790】米花宝出血大减价
【791】高木刑警戴着手铐逃走
【792】三人是第一发现者（前篇）
【793】三人是第一发现者（后篇）
【794】保镳毛利小五郎
【795】年轻夫人消失的秘密
【796】鸳鸯夫妻的策略
【797】梦想少女的糊涂推理
【798】移动的目标
【799】侦探团的密室推理合战
【800】追逐一亿日圆
【801】鸟取神秘之旅（前篇）
【802】鸟取神秘之旅（后篇）
【1小时特别版】柯南与海老藏歌舞伎十八番疑案（前篇）【2016年1月9日动画原创】
【1小时特别版】柯南与海老藏歌舞伎十八番疑案（后篇）【2016年1月16日动画原创】